Este espacio se dedica exclusivamente a la producción de plantas nativas que crecen en climas mediterráneos.
La vegetación es amenazada y muchas de sus especies no se encuentran en ningún otro lugar, por ello, el objetivo del jardín es representar las principales comunidades de vegetación de zonas de clima mediterráneo de Chile, comprendidas entre las regiones de Coquimbo y Bío Bío, como también jardines con vegetación de otras regiones homoclimáticas del mundo tales como California, sudeste de Australia y sudeste de Sudáfrica y la cuenca del Mediterráneo europeo.
Para el seguimiento de las distintas especies, el Jardín Botánico Chagual realizó una identificación de éstas con cintas de colores que permiten determinar con precisión el lugar exacto que tendrán dentro de la zonificación, y etiquetas metálicas de aluminio que señalan claramente de cuál se trata. Gracias a esto, la comunidad científica puede monitorear los procesos de germinación y crecimiento de cada especie.